《医院会计制度--会计科目和会计报表》由财政部、卫生部于1998年颁布，该制度为适应社会主义市场经济体制要求，规范医院财务管理而制定 ，该制度后被全面修订 。
制度内容分为总说明、会计科目、会计科目使用说明、会计报表四部分。总说明明确适用范围及会计核算要素（资产、负债、基金、收入、支出、结余），采用权责发生制与借贷记账法，平衡公式为资产=负债+净资产。会计科目按资产类、负债类、基金类、收支类设立8项总账科目，并对48项总账科目的核算内容、记账方法作出具体规定。会计报表部分规定报表种类、格式及编制要求，包含财务分析内容及计算公式。制度依据财政部《事业单位会计准则(试行)和会计制度》制定，涵盖财务核算全流程技术规范 。该制度在实施过程中逐渐显现出滞后性和不适应性，如修购基金无法反映资产的真实价值、资产项目不完整等问题 。
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